BLAST算法使用局部比对搜索的策略 BLAST算法组成部分:列表、扫描、延伸 BLASTP算法可以描述为以下3个阶段 蛋白质搜索中,BLAST编译一个初步的两两比对序列,称为字段对 BLASTP算法编译了一个由查询序列生成的固定长度为w的字段列表。使用比对序列的分数建立一个阈值T。BLASTP字段大小默认为3(BLASTN为11),则20种氨基酸可能字段共有8000个。修改“字段大小”参数可以修改查询时间和灵敏度。 算法在整个数据库中扫描打到某个阈值分数T的字段对。若扫描出结果,则使用有空位和无空位比对方法延伸匹…

2021年11月9日 0条评论 4点热度 阅读全文